BER vs NER

Key Difference - ความเสียหายที่เกิดจากปัจจัยภายในและภายนอกต่างๆ อย่างไรก็ตามระบบเซลลูลาร์ซ่อมทันทีและแก้ไขความเสียหายอย่างต่อเนื่องก่อนที่จะกลายเป็นการกลายพันธุ์หรือก่อนที่จะถ่ายโอนไปยังคนรุ่นต่อ ๆ ไป มีอยู่สามประเภทของระบบการตัดตอนการซ่อมแซมในเซลล์: การซ่อมแซม excision nucleotide (NER) ซ่อมแซม excision ฐาน (BER) และซ่อมแซมไม่ตรงกันดีเอ็นเอ (MMR) เพื่อซ่อมแซมความเสียหาย DNA เดียวควั่น ข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่างการตัดตอนมาจากฐานและการตัดตอนมาจากการตัดต่อนิวคลีโอไทด์คือ

การซ่อมแซมการตัดรากฐานฐานเป็นระบบซ่อมง่ายๆที่ทำงานในเซลล์เพื่อซ่อมแซมความเสียหายของ nucleotide เดี่ยวที่เกิดจาก endogenously ขณะที่ ระบบที่ทำงานในเซลล์เพื่อซ่อมแซมบริเวณที่ใหญ่กว่าเสียหายเกิดจากภายนอก

เนื้อหา

1 ภาพรวมและข้อแตกต่างที่สำคัญ

2. การซ่อมแซม Excision Base คืออะไร

3. การกำจัดสารนิวคลีโอไทด์คืออะไร

4. การเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน - การตัดตอนฐานและการซ่อมแซมการตัดไม้ทำลายด้วยนิวเคลียส

5. สรุป

การซ่อมแซมรากฐานคืออะไร?

การซ่อมแซมสารสกัดจากฐานเป็นระบบซ่อมแซม DNA ที่ง่ายที่สุดที่เซลล์มี ใช้เพื่อซ่อมแซมความเสียหายเล็กน้อยในดีเอ็นเอ ฐาน DNA มีการปรับเปลี่ยนเนื่องจากการ deamination หรือ alkylation เมื่อมีความเสียหายฐานดีเอ็นเอไกลโคเลสจะรู้จักและเปิดใช้งานระบบซ่อมแซมฐานการตัดใหม่และกู้คืนโดยใช้เอนไซม์ endonuclease, DNA polymerase และ DNA ligase ขั้นตอนต่อไปนี้เกี่ยวข้องกับระบบ BER

การรับรู้และการกำจัดฐานที่ไม่ถูกต้องหรือเสียหายจากดีเอ็นเอไกลโคเลสเพื่อสร้างสถานที่ที่เป็นโรคหอบหืด (สถานที่เกิดการสูญเสียเบส - ไซต์ปรีติรินหรือเพลี้ยจักจั่น)

1. การเจาะบริเวณ Abasic โดย endorucal apurinic / apyrimidinic
2. การกำจัดเศษน้ำตาลที่เหลือด้วย lase หรือ phosphodiesterase
3. การเติมช่องว่างด้วย DNA polymerase
4. การปิดผนึกของ nick โดย DNA ligase
5. < ! - 3 ->

รูปที่ 01: ทางเดินการตัดตอนมาสากฐาน

การซ่อมแซมสารนิวคลีโอไทด์คืออะไร?

การซ่อมแซมสารกัดกร่อนของ Nucleotide (NER) เป็นระบบซ่อมแซมดีเอ็นเอที่สำคัญในเซลล์ สามารถซ่อมแซมและเปลี่ยนพื้นที่ที่เสียหายได้ถึง 30 ฐานโดยมีแกนนำทางที่ไม่เสียหายเกิดความเสียหายร้ายแรงจากรังสีอัลตราไวโอเลตและ NER ปกป้องดีเอ็นเอโดยการซ่อมแซมความเสียหายเหล่านี้ทันทีก่อนที่จะเกิดการกลายพันธุ์และส่งผ่านไปยังคนรุ่นอนาคตหรือก่อให้เกิดโรค NER ให้การป้องกันการกลายพันธุ์โดยเฉพาะอย่างยิ่งทางอ้อมโดยปัจจัยภายนอกเช่นสารก่อมะเร็งทางสิ่งแวดล้อมและสารเคมี NER เห็นได้ในสิ่งมีชีวิตเกือบทั้งหมดและตระหนักถึงความเสียหายที่ก่อให้เกิดความผิดเพี้ยนอย่างมากในเกลียวดีเอ็นเอ

กระบวนการ NER เกี่ยวข้องกับการทำงานของโปรตีนจำนวนมากเช่น XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB เป็นต้นและดำเนินการผ่านกลไกการตัดและวางเหมือนหลาย ๆ โปรตีนเหล่านี้มีความจำเป็นสำหรับการทำให้กระบวนการซ่อมแซมเสร็จสมบูรณ์และข้อบกพร่องของโปรตีน NER มีความสำคัญอย่างยิ่งและสามารถทำให้เกิดอาการถอยหลังได้ยาก: xeroderma pigmentosum (XP), โรค Cockayne (CS) และรูปแบบแสงของความผิดปกติของเส้นผมเปราะ trichothiodystrophy (TTD)

รูปที่ 02: การกำจัดสารนิวคลีโอไทด์

อะไรคือความแตกต่างระหว่างการซ่อมแซมรากฟันเทียมและการกำจัดสารนิวคลีโอไทด์?

- ข้อแตกต่างระหว่างบทความก่อนหน้าตาราง ->

การตัดรากฟันฐานและการกำจัดสารเคมีด้วยวิธี nucleotide

การซ่อมแซมการตัดชิ้นเนื้อ (BER) เป็นระบบซ่อมแซม DNA เกิดขึ้นในเซลล์
การซ่อมแซมการตัดใหม่ของ Nucleotide (NER) เป็นอีกหนึ่งระบบซ่อมแซม DNA ที่พบได้ในเซลล์	การยอมรับ DNA Adducts
BER จะซ่อมแซมความเสียหายต่อ DNA adducts ขนาดเล็ก
NER ซ่อมแซม DNA adducts ที่มีขนาดใหญ่	ความเสียหายจาก DNA
BER ตระหนักถึงความเสียหายที่ไม่ก่อให้เกิดการบิดเบือนอย่างมากต่อเกลียวดีเอ็นเอ
NER ตระหนักถึงความเสียหายที่ทำให้เกิดการบิดเบือนอย่างมากต่อเกลที่ดีเอ็นเอ	สาเหตุของความเสียหายของดีเอ็นเอ
BER จะซ่อมแซมความเสียหายที่เกิดจาก mutagenens ภายในร่างกาย
NER ซ่อมแซมความเสียหายที่เกิดจาก mutagens ภายนอก	ความซับซ้อน
BER เป็นระบบซ่อมที่มีความซับซ้อนน้อยที่สุด
มันซับซ้อนกว่า BER	ความต้องการโปรตีน
BER ไม่จำเป็นต้องใช้โปรตีนชนิดอื่น
NER ต้องการผลิตภัณฑ์ยีนหลายชนิดโดยเฉพาะโปรตีนเพื่อแยกแยะความเสียหายของภูมิภาคที่เสียหายและไม่เสียหาย	ความเหมาะสม
BER เหมาะสำหรับการแก้ไขความเสียหายของชิ้นเดียว
NER เหมาะสำหรับเปลี่ยนพื้นที่ที่เสียหาย	ข้อมูลอย่างย่อ - การกำจัดสารสกัดจากรากฟันเทียมและการกำจัดสารเคมีด้วยวิธี Nucleotide

NER และ BER เป็นกระบวนการซ่อมแซม DNA excision 2 ชนิดที่พบได้ในเซลล์ BER สามารถซ่อมแซมความเสียหายขนาดเล็กที่เกิดจาก endogenously ขณะที่ NER สามารถซ่อมแซมพื้นที่ความเสียหายได้ถึง 30 คู่เบสที่มีสาเหตุมาจาก exogenously BER แตกต่างจาก NER ในประเภทพื้นผิวที่รับรู้และในเหตุการณ์การตัดทอนครั้งแรก BER สามารถรับรู้ความเสียหายที่ไม่ได้เกิดจากการบิดเบือนอย่างมากในเกล็ด DNA ในขณะที่ NER ตระหนักถึงความผิดเพี้ยนอย่างมากของเกล็ด DNA นี่คือความแตกต่างระหว่างการตัดตอนฐานและการตัดออกจากนิวคลีโอไทด์

รูปภาพมารยphép:

1. "Dna ซ่อมแซมฐาน excersion en" โดย LadyofHats - (Public Domain) โดยวิกิมีเดีย

2. "การเป็นตัวแทนแบบจำลองสำหรับเส้นทางการซ่อมแซมการตัดใหม่ของ nucleotide โดย Uvr proteins" โดย Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui และ Seiki Kuramitsu - (CC BY 10) via Commons Wikimedia

เอกสารอ้างอิง:

1. คิมยูนจองและเดวิดเอ็มวิลสัน "ภาพรวมของสารชีวเคมีในการซ่อมแซมสารสกัดด้วยเบส "เภสัชวิทยาโมเลกุลในปัจจุบัน U. S. หอสมุดแห่งชาติแพทยศาสตร์, มกราคม 2012. Web 14 มีนาคม 2017.

2. Boer, Jan De และ Jan H. J. Hoeijmakers "การซ่อมแซมการตัดตอนนิวเคลียสและกลุ่มอาการของมนุษย์ "การก่อมะเร็ง. Oxford University Press, 01 Mar. 2000 Web. 28 มีนาคม 2017

3. Hoogstraten et al. "การตรวจสอบความเสียหายของดีเอ็นเอที่มีอยู่โดยการซ่อมแซมโปรตีนนิวเคลียสนิวคลีโอดีเอ็นเอของโปรตีน XPC วารสารวิทยาศาสตร์เซลล์ บริษัท ชีววิทยา จำกัด, 01 กันยายน 2551 Web 28 มี.ค. 2017