ความแตกต่างระหว่าง Benzonase และ DNase | Benzonase vs DNase

Anonim

Key ความแตกต่าง - Benzonase vs DNase

การย่อยสลายกรดนิวคลีอิกมีความสำคัญต่อเทคนิคชีววิทยาระดับโมเลกุลหลายชนิด มีการใช้กันอย่างแพร่หลายในเทคโนโลยีดีเอ็นเอ recombinant เพื่อกำจัดชิ้นส่วนที่ไม่พึงประสงค์ของดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอ เอนไซม์ย่อยสลายกรดนิวคลีอิกเรียกว่า Nucleases และสามารถแตกต่างกันไปตามลักษณะการทำงานที่ต้องการ นิวเคลียสที่ย่อยสลายดีเอ็นเอเป็นที่รู้จักกันในชื่อ DNases ขณะที่สาร RNase ที่ย่อยสลาย เอนไซม์เหล่านี้มักใช้ในการทดลอง ในหลอดทดลอง ที่ ใน vitro การทดสอบทางโมเลกุลจะทำเพื่อแยก DNA, RNA หรือโปรตีนที่บริสุทธิ์ Benzonases เป็นประเภทของ nucleases ที่ย่อยสลาย DNA และ RNA ในขณะที่ DNases ย่อยดีเอ็นเอเพียงอย่างเดียว นี่คือข้อแตกต่างที่สำคัญระหว่าง Benzonase และ DNase

เนื้อหา

1 ภาพรวมและข้อแตกต่างที่สำคัญ

2. Benzonase คืออะไร

3. DNase คืออะไร

4. ความคล้ายคลึงกันระหว่าง Benzonase และ DNase

5. เปรียบเทียบระหว่าง Benzonase กับ DNase ในรูปแบบตาราง 6 สรุป

Benzonase คืออะไร?

Benzonase เป็น endonuclease ที่ดัดแปลงทางพันธุกรรมจาก Serratia marcescens

เอนไซม์นี้ผลิตใน E coli เจ้าภาพในระดับอุตสาหกรรม Benzonase มีความสามารถในการตัดดีเอ็นเอแบบคู่ขนานดีเอ็นเอเชิงเส้นดีเอ็นเอแบบวงกลมและ RNA แบบเส้นเดียว Benzonase จึงมีความสำคัญทางการค้า เอนไซม์ Benzonase เป็น dimer โปรตีนที่มี 245 กรดอะมิโนที่เหมือนกัน ~ 30 kDa ยูนิตที่มีสองพันธะซัลไฟด์ที่สำคัญ Benzonase จะกลืนกรดนิวคลีอิกไว้ที่ปลายด้าน 5 'และส่งผลให้เกิดเศษที่มีอิสระ 5 ส่วน Benzonase สามารถแยกกรดนิวคลีอิกที่ลำดับใด ๆ แต่ชอบที่อุดมไปด้วยภูมิภาค GC

Benzonase ถูกเก็บไว้ที่ -20

0

C ค่าความเป็นกรด - ด่างที่เหมาะสมสำหรับการทำงานของเอนไซม์พบว่ามีค่าเท่ากับ 8. 0 - 9 2. การประยุกต์ใช้เบนโซเนส ได้แก่ การเตรียมตัวอย่างสำหรับการเจลอิเล็กโตรโฟเรสเตอรอลแบบโปรตีนโปรตีน 2 มิติที่ Benzonase ขจัดกรดนิวคลีอิกที่ถูกจับและการกำจัดสารปนเปื้อนของกรดนิวคลีอิก นอกจากนี้ยังใช้เพื่อลดความหนืดของสารสกัดจากโปรตีนและป้องกันการเกาะตัวของเซลล์ในเซลล์ผสม

DNase คืออะไร?

DNase เป็น nuclease ซึ่งเป็นเอนไซม์ที่สามารถย่อยสลาย DNA แบบ double-stranded ได้ DNase I และ DNase II มี 2 ประเภทหลักดังนี้ DNase ฉันมีส่วนร่วมในการตัดดีเอ็นเอแบบคู่ขนานเพื่อผลิต polynucleotides ที่มีปลายด้าย 5 ' DNase II มีส่วนร่วมในการตัดดีเอ็นเอแบบคู่ขนานเพื่อสร้างเส้นใยโพลีนูโนคลอเรสต์ที่มีปลายหรือแขวนลอยฟรี 3 '

DNase I

DNase I ทำงานที่ pH ที่เหมาะสมระหว่าง 7. 0 - 8. 0. กิจกรรมของเอนไซม์ขึ้นอยู่กับ cofactors ไอออนิกจำนวนมากซึ่งประกอบด้วย Ca 2+ Mg

2 + หรือ Mn

2+ กิจกรรมของ Mg 2+ และ Mn 2+ จะตัดสินใจเกี่ยวกับหน้าที่ของ DNase I. เมื่อมี Mg 2+ DNase I จะตัดถอนแต่ละส่วนของ dsDNA อย่างอิสระ นี้เกิดขึ้นในลักษณะสุ่ม ในทางตรงกันข้ามเมื่อมี Mn 2+, เอนไซม์จะตัดเส้นใย DNA ทั้งสองข้างออกจากบริเวณเดียวกัน ความแตกแยกนี้จะส่งผลให้เกิดชิ้นส่วนดีเอ็นเอสองประเภท ประเภทหนึ่งที่มีปลายทื่อและประเภทอื่นที่มีหนึ่งหรือสองยื่นออกมานิวคลีโอไทด์ รูปที่ 2: DNase DNase II DNase II มีค่า pH ที่เหมาะสมที่สุดคือ 4. 5-5 0 และไอออนโลหะดิไวฟอร์มจะต้องใช้สำหรับกิจกรรมเช่นเดียวกับ DNase I. กลไกของ DNase II เป็นที่ทราบกันดีว่าประกอบด้วยสามขั้นตอนหลัก มีการหยุดพักของเส้นใยเดี่ยวหลายอันภายในแกนหลักของ DNA มีการผลิต nucleotides ที่เป็นกรดและ oligonucleotides

การเปลี่ยนแปลงของไฮโดรเจนแบบไม่เชิงเส้นเกิดขึ้นในเฟสสุดท้าย

สารยับยั้งหลักของเอนไซม์ DNase ได้แก่ โลหะเคลเทอร์โลหะการเปลี่ยนถ่ายและสารเคมีเช่นโซเดียม dodecyl sulfate และβ - mercaptoethanol

การใช้งานหลักของ DNase ได้แก่ การจัดเตรียมสารสกัดจาก RNA และสารสกัดโปรตีนจากดีเอ็นเอและการกำจัดดีเอ็นเอของแม่ในระหว่างการทดลองถอดรหัสในหลอดทดลอง

  1. อะไรคือความคล้ายคลึงกันระหว่าง Benzonase และ DNase?
  2. ทั้งสองเป็นเอนไซม์ที่ย่อยสลายได้
  3. ทั้งสองเป็น nucleases

ทั้งสองมีส่วนร่วมโดยการตัดพันธะ phosphodiester ของกรดนิวคลีอิก

ทั้งสองต้องมี pH ที่เหมาะสมและอุณหภูมิในการเก็บรักษาเพื่อรักษาความสามารถในการทำงานของเอนไซม์

สารยับยั้งเอนไซม์ประกอบด้วยสารเคมีที่เป็นคีเลตโลหะการเปลี่ยนถ่ายและสารเคมีผงซักฟอก

  • แอพพลิเคชันส่วนใหญ่เน้นการสกัดสารดีเอ็นเออาร์เอ็นเอและโปรตีนที่มีความบริสุทธิ์สูง
  • เอนไซม์ทั้งสองสามารถผลิตได้ผ่านทางพันธุวิศวกรรม
  • อะไรคือความแตกต่างระหว่าง Benzonase และ DNase?
  • - อื่น ๆ บทความก่อนกลางตาราง ->
  • Benzonase vs. DNase
  • Benzonase เป็นเอนไซม์ที่มีความสามารถในการตัดดีเอ็นเอแบบคู่ขนานดีเอ็นเอเชิงเส้นดีเอ็นเอแบบวงกลมและอาร์เอ็นเอ
  • DNase เป็นเอนไซม์ที่มีความสามารถในการตัด DNA แบบ double-stranded

Substrate for Enzyme

ทั้งดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอเป็นสารตั้งต้นสำหรับเบนโซเนส DNA

เป็นสารตั้งต้นสำหรับ DNase

โครงสร้าง ช่วง pH ที่เหมาะสมของ Benzonase คือ 7. 0 -8 0
ช่วง pH ที่เหมาะสมของ DNase I คือ 7. 0 - 8. 0 และ DNase II คือ 4. 5 - 5. 0.
สรุป - Benzonase vs. DNase เอนไซม์ Nuclease ใช้กันอย่างแพร่หลายในกระบวนการทดลองต่างๆ เกี่ยวกับอณูชีววิทยาโมเลกุลและพันธุวิศวกรรม Benzonase และ DNase เป็น nucleases สองประเภท Benzonase เกี่ยวข้องกับการย่อยสลาย DNA และ RNA ในขณะที่ DNase มีส่วนเกี่ยวข้องในการตัด DNA แบบ double-stranded นี่คือความแตกต่างพื้นฐานระหว่าง benzonase และ DNase ปัจจุบันทั้งสองชนิดของ nuclease เหล่านี้ได้รับการผลิตผ่านเทคโนโลยีดีเอ็นเอรีคอมบิแนนท์ซึ่งทำให้ได้เอนไซม์ที่มีคุณภาพสูงขึ้นซึ่งเหมาะสำหรับการผลิตสูงสุด
ดาวน์โหลดเวอร์ชัน PDF ของ Benzonase และ DNase
คุณสามารถดาวน์โหลดฉบับ PDF ของบทความนี้และใช้เพื่อวัตถุประสงค์ออฟไลน์ตามหมายเหตุอ้างอิง โปรดดาวน์โหลดไฟล์ PDF ที่นี่ความแตกต่างระหว่าง Benzonase และ DNase เอกสารอ้างอิง:

1. "Deoxyribonuclease I จากตับอ่อนตับอ่อน D5025 "Sigma-Aldrich, จำหน่ายที่นี่ เข้าถึง 19 กันยายน 2017

2. "Deoxyribonuclease II. Deoxyribonuclease II - คู่มือการใช้เอนไซม์ Worthington ที่มีจำหน่ายที่นี่ เข้าถึง 19 กันยายน 2017

รูปภาพมารยphép:

1. "DNAse hypersensitive site" โดย Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N และอื่น ๆ - Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. (2012) ความสัมพันธ์ระหว่าง DNase I การกระจายตัวของเว็บไซต์ที่มีฤทธิ์อ่อนเพลียและการแสดงออกของยีนในเซลล์ HeLa S3 PLOS ONE 7 (8): e42414 doi: 10.1371 / journal ขนมปังคอร์น 0042414 (CC BY-SA. 2. 5) ผ่านวิกิพีเดีย: