ความแตกต่างระหว่าง AFLP กับ RFLP | AFLP vs RFLP

Anonim

ความแตกต่างที่สำคัญ - AFLP vs RFLP การศึกษาดีเอ็นเอมีความสำคัญอย่างมากในการทำความเข้าใจและกำหนดความสัมพันธ์เกี่ยวกับลำดับวิวัฒนาการการวินิจฉัยโรคทางพันธุกรรมและการทำแผนที่ของสิ่งมีชีวิต นอกจากนี้ยังมีเทคนิคหลายอย่างที่เกี่ยวข้องกับการวิเคราะห์ดีเอ็นเอเพื่อระบุยีนหรือลำดับดีเอ็นเอในสระว่ายน้ำของดีเอ็นเอที่ไม่รู้จัก พวกเขาเป็นที่รู้จักกันเป็นเครื่องหมายโมเลกุล

(RFLP) เป็นเครื่องหมายโมเลกุลสองแบบ (วิธีการ) ที่พัฒนาขึ้นในด้านชีววิทยาระดับโมเลกุลเพื่อตรวจจับความผันแปรทางพันธุกรรมระหว่างสิ่งมีชีวิต ทั้งสองวิธีมีความสำคัญเท่าเทียมกันและมีข้อดีและข้อเสีย ความแตกต่างที่สำคัญระหว่าง AFLP และ RFLP คือการที่ AFLP เกี่ยวข้องกับการขยาย PCR ที่มีการคัดเลือกของดีเอ็นเอย่อยลงในขณะที่ RFLP ไม่เกี่ยวข้องกับการขยาย PCR ของชิ้นส่วนดีเอ็นเอ เนื้อหา 1 ภาพรวมและข้อแตกต่างที่สำคัญ 2. AFLP คืออะไร

3. RFLP คืออะไร

4. การเปรียบเทียบแบบเคียงข้างกัน - AFLP vs RFLP

5. สรุป

AFLP คืออะไร?

AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) เป็นเครื่องมือสำคัญในชีววิทยาโมเลกุลและใช้ในการวิเคราะห์ความแปรปรวนทางพันธุกรรมอย่างกว้างขวาง AFLP ขึ้นอยู่กับการขยาย PCR ที่เฉพาะเจาะจงของดีเอ็นเอจีโนมที่กระจัดกระจายและการตรวจสอบความหลากหลายโดย autoradiographs ผ่านทางอิเล็กโทรเฟอร์เจล AFLP มีส่วนช่วยในการระบุความแตกต่างทางพันธุกรรมในสายพันธุ์หรือสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดของราชอาณาจักรต่างๆรวมทั้งพืชสัตว์แบคทีเรียและเชื้อรา AFLP สามารถดำเนินการกับจำนวนน้อยของตัวอย่างดีเอ็นเอที่ไม่รู้จัก ไม่จำเป็นต้องมีความรู้ลำดับขั้นและการออกแบบหัววัด

ขั้นตอนในการแยก DNA ของ AFLP

การย่อยโปรตีนด้วย endonucleases ข้อ จำกัด

การลดความผิดพลาดของชิ้นส่วน DNA ที่มีข้อ จำกัด ด้วยอะแดปเตอร์

การขยายตัวของชิ้นส่วนที่มีข้อ จำกัด เฉพาะ การแยกชิ้นส่วนของผลิตภัณฑ์ PCR โดยการเจลอิเล็กโทรฟิเรสซิสการวิเคราะห์รูปแบบของเจลโดย Autoradiograph

AFLP เป็นวิธีการที่มีความไวและสามารถทำซ้ำได้มากขึ้นซึ่งสามารถนำมาใช้ในการทำโปรไฟล์ดีเอ็นเอของ taxa ได้แก่ เชื้อราแบคทีเรียพืชและ สัตว์ที่ไม่มีความรู้เกี่ยวกับลำดับเบสดีเอ็นเอ ช่วยในการระบุความแตกต่างเล็กน้อยระหว่างบุคคลในประชากรเนื่องจากลักษณะที่มีความละเอียดอ่อนสูง AFLP มีส่วนสำคัญในการทำแผนที่จีโนมการศึกษาด้านนิติวิทยาศาสตร์การทดสอบโดยผู้ปกครอง genotyping ฯลฯ

  1. รูปที่ 01: AFLP
  2. RFLP คืออะไร?
  3. การจํากัดความจํากัดความยาว Polymorphisms (RFLPs) เป็นเทคนิคที่ใช้ในการตรวจจับการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมในลำดับดีเอ็นเอของ homologousเป็นวิธีการแรกในการสร้างโปรไฟล์ดีเอ็นเอ สิ่งมีชีวิตมีลายพิมพ์ดีเอ็นเอหรือดีเอ็นเอที่ไม่ซ้ำกัน RFLP ทำหน้าที่เป็นเครื่องมือสำคัญในการวิเคราะห์ความแตกต่างระหว่างรูปแบบดีเอ็นเอของสิ่งมีชีวิตที่อยู่ภายในหรือใกล้ชิดกันเนื่องจากลำดับเบสที่เหมือนกันมีสถานที่ จำกัด ที่แตกต่างกันซึ่งเป็นเอกลักษณ์เฉพาะของสิ่งมีชีวิตนั้น ๆ เมื่อดีเอ็นเอที่คล้ายคลึงกันถูกย่อยด้วย endonucleases จำกัด เฉพาะจะทำให้เกิดรูปแบบดีเอ็นเอที่แตกต่างกันซึ่งเป็นเอกลักษณ์ของแต่ละบุคคล ดังนั้นหลักของวิธีนี้คือการตรวจหาความผันแปรทางพันธุกรรมของสิ่งมีชีวิตโดยการ จำกัด DNA ที่เหมือนกันกับเอนไซม์ที่ จำกัด เฉพาะและการวิเคราะห์ความยาวของความยาวส่วนด้วย gel electrophoresis และ blotting รูปแบบการบวมเป็นเอกลักษณ์ของสิ่งมีชีวิตแต่ละชนิดและแสดงลักษณะเฉพาะของยีน
  4. ขั้นตอนการแยก RFLP
  5. การแยก DNA ออกจากตัวอย่างที่ต้องการ

การแยกชิ้นส่วนของดีเอ็นเอด้วย endonucleases จำกัด เฉพาะเป็นลำดับสั้น ๆ

การแยกชิ้นส่วนที่ได้รับออกด้วยความยาวต่างกันโดยใช้ agarose gel electrophoresis

การถ่ายโอนโปรไฟล์เจลลงในเมมเบรนโดย Southern blotting

การผสมผสานของเมมเบรนกับการตรวจสอบที่มีข้อความกำกับและการวิเคราะห์ความยาวของความยาวส่วนในแต่ละโปรไฟล์

RFLP เป็นเทคนิคที่สำคัญมากในการตรวจหาการสืบทอดโรคและการค้นหา ความเสี่ยงต่อการเกิดโรคในหมู่สมาชิกในครอบครัว RFLP มักใช้ในการทำแผนที่จีโนมการระบุอาชญากรในด้านนิติเวชการทดสอบความเป็นพ่อ ฯลฯ RFLP มีข้อ จำกัด หลายประการเช่นกัน RFLP ต้องการความรู้ก่อนหน้าของข้อมูลลำดับเพื่อออกแบบ probes สำหรับการผสมพันธุ์ นอกจากนี้ยังต้องแยก DNA จำนวนมากออกจากตัวอย่างเพื่อวิเคราะห์ซึ่งเป็นเรื่องที่ยากสำหรับการศึกษาทางนิติวิทยาศาสตร์

รูปที่ 01: การทำแผนที่ RRFLP

  1. ความแตกต่างระหว่าง AFLP กับ RFLP คืออะไร?
  2. - diff บทความกลางก่อนตาราง -> ALFP vs RFLP
  3. AFLP เกี่ยวข้องกับการเลือก PCR amplification ของ DNA ย่อย
  4. RFLP ไม่เกี่ยวข้องกับ PCR เว้นแต่จะเป็น PCR-RFLP
  5. ลำดับความรู้

ไม่จำเป็นต้องมีลำดับความรู้ก่อน

ความรู้เกี่ยวกับลำดับก่อนจำเป็นต้องใช้ในการออกแบบ RFLP probes

ความน่าเชื่อถือ

นี่น่าเชื่อถือมากขึ้น

นี่ไม่น่าเชื่อถือเมื่อเปรียบเทียบกับ AFLP

ประสิทธิภาพในการตรวจจับเรขาคณิต นี่มีประสิทธิภาพในการตรวจหาความหลากหลายทางพันธุกรรมมากกว่า RFLP
นี่คือประสิทธิภาพที่น้อยลงเมื่อเทียบกับ AFLP
ต้นทุน นี่เป็นราคาแพงเมื่อเทียบกับ RFLP เล็กน้อย
ราคานี้ไม่แพงเมื่อเทียบกับ AFLP
แอพพลิเคชัน AFLPs ถูกนำมาใช้กับการทำแผนที่จีโนม, การตรวจลายพิมพ์ดีเอ็นเอ, การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรม, การทดสอบความเป็นพ่อและการพิสูจน์หลักฐาน
การวิเคราะห์ RFLP เป็นเครื่องมือสำคัญในการทำแผนที่จีโนม, การ จำกัด ยีนสำหรับความผิดปกติทางพันธุกรรม, การกำหนดความเสี่ยง โรคและการทดสอบความเป็นบิดา
ข้อมูลสรุป - AFLP vs RFLP AFLP และ RFLP เป็นเทคนิคสองวิธีที่ใช้เป็นเครื่องหมายทางพันธุกรรมสำหรับการประเมินความหลากหลายและการประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมในชีววิทยาโมเลกุลAFLP ทำหน้าที่เป็นวิธีที่มีประสิทธิภาพและมีความละเอียดอ่อนในการตรวจหาความแตกต่างของยีนระหว่างสิ่งมีชีวิตมากกว่า RFLP อย่างไรก็ตามแม้ว่าวิธีการเหล่านี้จะมีประสิทธิภาพในการตรวจจับการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรม แต่ก็ยังคงใช้สำหรับการตรวจหาลายพิมพ์ดีเอ็นเอและการวินิจฉัยโรค
การอ้างอิง:
'1. Garcia, Antonio A. F., Luciana L. Benchimol, Antôniaเมตร M. Barbosa, Isaias O. Geraldi, Souza จูเนียร์Cláudio L. และ Anete P. De Souza "การเปรียบเทียบเครื่องหมาย RAPD, RFLP, AFLP และ SSR สำหรับการศึกษาความหลากหลายในสายพันธุ์ผสมข้าวโพดเลี้ยงสัตว์เขตร้อน พันธุศาสตร์และชีววิทยาโมเลกุล Sociedade Brasileira de Genética, 2004 เว็บ 19 มีนาคม 2017 2. "ข้อ จำกัด ความยาวพอลิเมอร์ Polymorphism (RFLP) ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ U. S. หอสมุดแห่งชาติแพทยศาสตร์ n. d เว็บ. 19 มีนาคม 2017
3. Masiga D. K. และ Turner C. M. (2004) การวิเคราะห์ความหลากหลายของส่วนขยาย (restriction) (restriction) (AFLP) ". วิธี Mol Biol: 270: 173-86 NCBI เว็บ. 19 มี.ค. 2017
รูปภาพมารยphép: 1. "ALFP" โดย Barbarossa จากดัตช์วิกิพีเดีย - โอนจาก nl วิกิพีเดียไปที่ Commons (โดเมนสาธารณะ) ผ่านวิกิพีเดีย:

2. "RFLP mapping" โดย Retama - งานของตัวเอง (GFDL) via Commons วิกิพีเดีย