ความแตกต่างระหว่าง SiRNA และ shRNA | shRNA vs siRNA

shRNA vs siRNA

ระหว่างกระบวนการของ RNA interference (RNAi) การแสดงออกของยีนเป้าหมายจะลดลงด้วยความจำเพาะและความจำเพาะสูง RNAi เป็นกระบวนการทางธรรมชาติและเกี่ยวข้องกับ RNA รบกวน (siRNA) และ RNA (shRNA) สั้นและ shRNA แบบสองหน้าที่ ปัจจุบัน RNAi ถูกใช้เป็นเครื่องมือในการรักษามะเร็ง การใช้งานของ RNAi นั้นทำขึ้นโดยใช้ไซรัปที่มีสังเคราะห์ทางเคมีสังเคราะห์และโมเลกุล shRNA แบบเวกเตอร์ แม้ว่าทั้งสองโมเลกุลมีผลการทำงานที่คล้ายคลึงกัน แต่ก็ต่างไปจากโครงสร้าง ดังนั้นกลไกโมเลกุลของการกระทำเส้นทาง RNA และผลกระทบที่ไม่ได้กำหนดเป้าหมายของโมเลกุลทั้งสองนี้ต่างกัน

shRNA เป็นลำดับของโมเลกุลอาร์เอ็นเอเล็ก ๆ ที่ทำให้การเปิดใช้กิ๊บแน่นซึ่งสามารถใช้เพื่อยับยั้งการแสดงออกของยีนเป้าหมายในช่วง RNAi การแสดงออกของ shRNA ทำได้โดยเวกเตอร์ซึ่งอาจเป็นได้ทั้งไวรัสหรือแบคทีเรียหรือโดยการส่ง plasmids พวกเขาถูกสังเคราะห์ในนิวเคลียสของเซลล์และขนส่งไปยัง cytoplasm สำหรับกระบวนการต่อไป โมเลกุลเหล่านี้มีเส้นทางการเจริญเติบโตที่เหมือนกันของ miRNA; ดังนั้นการสังเคราะห์ miRNA จึงเป็นรากฐานสำหรับการสังเคราะห์ shRNA ทั้ง RNA polymerase II หรือ III สามารถถ่ายทอด shRNA ผ่านโปรโมเตอร์ RNA polymerase II หรือ III ข้อได้เปรียบของการใช้ shRNA คืออัตราการย่อยสลายและการหมุนเวียนที่ค่อนข้างต่ำ ข้อเสียคือต้องใช้เวคเตอร์นิพจน์ซึ่งอาจทำให้เกิดปัญหาด้านความปลอดภัยบางอย่าง

siRNAs siRNA เป็นโมเลกุลอาร์เอ็นเอแบบคู่ซึ่งประกอบด้วยคู่ความยาว 20-25 คู่ เหล่านี้ใช้สำหรับการยับยั้งยีนโดยการยับยั้งยีนใด ๆ ที่มีลำดับ nucleotide เสริมในทางเดิน RNAi ยีน knockdown โดย transfection ของ siRNA มักจะไม่ประสบความสำเร็จเนื่องจากผลชั่วคราว; โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการแบ่งเซลล์อย่างรวดเร็วและการปราบปรามไม่นาน เพื่อแก้ไขปัญหานี้ siRNA ได้รับการแก้ไขโดยการแนะนำโครงสร้างกิ๊บสั้น โมเลกุลที่ดัดแปลงนี้รู้จักกันในชื่อ shRNA shRNA ควรเปลี่ยนเป็น siRNA โดย Dicer เพื่อดำเนินการตามปกติของฟังก์ชัน

อะไรคือความแตกต่างระหว่าง shRNA กับ siRNA?

•แตกต่างจาก siRNA, shRNA มีโครงสร้างขนคิ้วเพิ่ม shRNA เป็นรุ่นที่ปรับเปลี่ยนของ siRNA

• shRNA ต้องการเวคเตอร์นิพจน์ในขณะที่ siRNA ไม่ได้

• shRNA สามารถใช้สำหรับ knockdown ในระยะยาวได้ในขณะที่ siRNA สามารถใช้ได้เฉพาะกับ knockdown ยีนระยะสั้นเท่านั้น

•การยับยั้งยีนของ siRNA ไม่เหมือนกับการยับยั้งยีนของ siRNA หากยับยั้ง shRNA เป็นเวลานานและถ้าถูกสอดผ่านทางเวกเตอร์ไวรัสที่เหมาะสมอาจทำให้เกิดการยับยั้งยีนได้อย่างถาวร

• Dicer จำเป็นต้องแปลง shRNA กลับไปเป็นโมเลกุล siRNA เพื่อให้สามารถทำงานได้ตามปกติ